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小分子蛋白如何跑WB?

時間:2025/4/27閱讀:528
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在日常實(shí)驗(yàn)過程中,小分子蛋白是非常常見的,常見的凋亡蛋白如Bcl2、Caspase-3、Bax,自噬相關(guān)蛋白如LC3B等均為小分子蛋白,接下來將從以下幾個方面分享小分子蛋白跑Wb時的注意事項:

小分子蛋白如何跑WB?

1. 配膠:整體配膠遵循蛋白分子量越小膠濃度越大的原則,對于小分子蛋白來說,分離膠濃度一般為12%-15%,對于小分子蛋白條帶可以分的更加清晰。同時在倒膠時濃縮膠的比例可以適當(dāng)增加到4:6,使其充分濃縮,后續(xù)電泳過程中一定程度上可以減少彌散。


2. 上樣:根據(jù)日常上樣經(jīng)驗(yàn),建議在跑小分子蛋白時增加1倍上樣量,防止蛋白彌散過多。選擇marker時,選擇適用于小分子蛋白的marker,后續(xù)敷抗體時可以更清楚的進(jìn)行裁膜。電泳開始前可用1′loadingbuffer補(bǔ)齊未點(diǎn)樣的膠孔,防止兩邊不齊跑成“八"字。


小分子蛋白如何跑WB?

3. 電泳:濃縮膠部分設(shè)置恒壓70V、30min左右,一般即可濃縮到一條線上之后調(diào)大電壓至110V,至所需蛋白區(qū)域全部分開為止。盡量避免長時間低電壓跑膠,易導(dǎo)致蛋白彌散過多。同時整個電泳過程中注意降溫。


4. 轉(zhuǎn)膜:由于小分子蛋白分子量小,吸附能力弱,因此轉(zhuǎn)膜時選擇0.22μm的PVDF膜,常規(guī)0.45μm膜容易穿透,剩余條件同正常蛋白一般可以滿足條件。


5. 封閉:快速封閉液或脫脂牛奶按正常條件封閉即可。裁膜時根據(jù)marker上下留出足夠多的空間。


6. 一抗孵育:在保證上述條件的基礎(chǔ)上,一抗是出好結(jié)果的關(guān)鍵一步,若沒前期實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn),一抗的稀釋比一般按照說明書配置,若有前期實(shí)驗(yàn)的經(jīng)驗(yàn),可適當(dāng)進(jìn)行比例調(diào)整,一抗?jié)舛冗^高最后顯影階段易出現(xiàn)雜帶,過低則可能看不到條帶。使用1′TBST緩沖液稀釋,4℃孵育過夜。

7.
后續(xù)二抗比例及孵育時間、顯影按常規(guī)操作即可。需要注意若抗體不好用或者蛋白難出結(jié)果,在敷完一二抗時可適當(dāng)延長洗膜時間及次數(shù)。

注意事項:

1. 轉(zhuǎn)膜時,若蛋白分子量過小,可適當(dāng)提高甲醇比例(30%左右)改善吸附能力。

2. 跑小分子蛋白時marker盡量不跑到一張膜上,對于常見內(nèi)參GAPDH、Actin及Tubulin等來說,分離膠濃度大上述蛋白區(qū)域一般分不開或分離不完整,易導(dǎo)致內(nèi)參不齊。

以上就是本期的內(nèi)容,更多資訊,
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