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實時熒光定量 PCR 操作流程及注意事項--RNA模板的制備

時間:2025/2/26閱讀:468
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一、RNA模板的制備
常見的RNA提取的方法:傳統(tǒng)的酚CHCl?抽提法和柱式抽提法。
操作流程概要
酚CHCl?抽提法
以 Vazyme 產品 RNA isolater Total RNA Extraction Reagent (Vazyme #R401) 為例
自備材料
CHCl?,異丙醇,75% 乙醇 (DEPC 水配制 ),DEPC 水
組分
                                                                                                                                                                                                         
樣本制備(過多的樣本量可能會導致樣本裂解不充分,并使產物純度降低;)
1ml RNA is olater 能夠充分裂解的最大樣本量如下:                                                                                                                                                                                                                                                                  
貼壁細胞(對于貼壁牢固的細胞可用細胞刮勺剝離細胞)
1.棄培養(yǎng)液,PBS 洗滌一次。
2.每 10 cm2 培養(yǎng)面積的細胞加入 1-3 ml RNA isolater,使之充分覆蓋到細胞表面,
然后用移液器將細胞吹打下來。
3.將裂解液轉移至 1.5 ml 離心管中,用移液器反復吹打直至無明顯顆粒樣存在。

冰上靜置 5 min


懸浮細胞
1、離心收集細胞,PBS 洗滌一次。
2、每 5 ⅹ 106 -107 個細胞加入 1 ml RNA isolater。

3、用移液器反復吹打直至無明顯顆粒樣存在。冰上靜置 5 min。


動物組織
液氮研磨(部分研磨會影響 RNA 的得率和質量):
1、將液氮研磨的粉末立即轉移至離心管中,加入 RNA isolater 裂解液,靜置。待樣品全部融化后,再繼續(xù)吹打至裂解液透明。
2、將裂解液轉移至離心管中,12,000 × g 4℃離心 5 min,吸取上清。
勻漿處理:
1、可將新鮮組織盡量剪碎浸泡在 RNA isolater 裂解液中,用電動勻漿器高速勻漿,將組織全部研磨均勻。
2、將裂解液轉移至離心管中,12,000 × g 4℃離心 5 min,吸取上清。

提取流程        
實時熒光定量 PCR 操作流程及注意事項--RNA模板的制備                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
柱式抽提法

以 Vazyme 產品 FastPureTM Cell/Tissue Total RNA Isolation Mini Kit (Vazyme #RC101/RC111) 為例


自備材料
組分
β- 巰基乙醇、無水乙醇、RNase-free 槍頭等。

實時熒光定量 PCR 操作流程及注意事項--RNA模板的制備
培養(yǎng)細胞
貼壁細胞:

無需消化,可直接使用 Buffer RL1( 已加入 β- 巰基乙醇 ) 進行消化、裂解;或用胰酶消化后離心收集細胞加入 Buffer RL1( 已加入 β- 巰基乙醇 ),每 2-5×106 個細胞加入 500 μl Buffer RL1。用移液器反復吹打混勻直至看不到細胞團塊。(使用前在 Buffer RL1 加入 β- 巰基乙醇至終濃度為 1%(如1 ml Buffer RL1 中加入 10 μl β- 巰基乙醇),盡量現(xiàn)配現(xiàn)用)


懸浮細胞:
直接離心收集細胞,加入 Buffer RL1( 已加入 β- 巰基乙醇 ),每 2-5×106 個細胞加入 500 μl Buffer RL1,用移液器反復吹打混勻直至看不見細胞團塊。(每 2-5×106 個細胞加入 500 μl Buffer RL1,細胞裂解完后若不立即進行下一步操作,可以置于 -70℃、保存)
提取流程
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實時熒光定量 PCR 操作流程及注意事項--RNA模板的制備

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