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翌圣生物科技(上海)股份有限公司

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從來(lái)源到應(yīng)用!揭秘DNase I的價(jià)值!

2025-4-24  閱讀(88)

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01

引 言


在分子生物學(xué)的研究領(lǐng)域中,酶作為重要的生物催化劑,發(fā)揮著的作用。其中,DNase I(脫氧核糖核酸酶I)作為一種能夠消化單鏈或雙鏈DNA的核酸內(nèi)切酶,在核酸的研究、分析和操作中占據(jù)著關(guān)鍵地位。它就像一把精準(zhǔn)的“分子剪刀",能夠特異性地切割DNA分子,為眾多生物學(xué)實(shí)驗(yàn)提供了有力的工具。本文將深入探討DNase I的來(lái)源、生產(chǎn)工藝、作用原理以及廣泛用途。

 

02

DNase I的來(lái)源

01

動(dòng)物來(lái)源

DNase I最初主要從牛胰腺中純化得到。牛胰腺是RNase A的豐富來(lái)源,因此對(duì)于牛胰來(lái)源的DNase I去除RNase A的工藝非常關(guān)鍵;牛胰來(lái)源的DNase I的優(yōu)勢(shì)在于,來(lái)源廣,能實(shí)現(xiàn)批量化生產(chǎn),酶活高等優(yōu)點(diǎn);但是牛胰腺中可能含有其他雜質(zhì)和污染物,增加了純化的難度;另一方面,有些生物制品不能接受動(dòng)物來(lái)源的DNase I,這時(shí)需要重組來(lái)源的DNase I來(lái)替換。

02
重組來(lái)源

隨著生物技術(shù)的發(fā)展,開(kāi)始采用重組技術(shù)生產(chǎn)DNase I。目前,常見(jiàn)的重組表達(dá)系統(tǒng)包括酵母畢赤酵母和大腸桿菌(E. coli)菌株。這種生產(chǎn)方式可以降低污染RNase的水平。在重組大腸桿菌菌株中表達(dá)的DNase I,不含RNase,可用于各種RNA樣品的處理,如RNA提取或反轉(zhuǎn)錄前去除基因組DNA,體外轉(zhuǎn)錄去除模板DNA等。重組技術(shù)的運(yùn)用使得DNase I的生產(chǎn)更加高效、安全,并且能夠更好地滿(mǎn)足不同實(shí)驗(yàn)和應(yīng)用的需求。但是重組技術(shù)生產(chǎn)DNase I既要實(shí)現(xiàn)高酶活,又要放大發(fā)酵工藝,確保低殘留,這種工藝實(shí)現(xiàn)的難度較大,成本較高。

 

03

DNase I的作用原理

01

與底物的結(jié)合

DNase I首先通過(guò)靜電相互作用與DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的磷酸骨架結(jié)合。

02
水解反應(yīng)

與DNA分子結(jié)合后,DNase I的活性中心結(jié)構(gòu)域與DNA分子作用。使底物分子的磷酸二酯鍵斷裂,生成相應(yīng)的寡核苷酸片段。

03
金屬離子的作用

DNase I的活性依賴(lài)于鈣離子(Ca2?),并能被鎂離子(Mg2?)或二價(jià)錳離子(Mn2?)激活。

 

04

DNase I的用途

01

RNA純化

在RNA提取過(guò)程中,常常會(huì)混入基因組DNA,這些DNA會(huì)對(duì)后續(xù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生干擾。例如,在進(jìn)行mRNA表達(dá)量分析、轉(zhuǎn)錄組分析、RT—qPCR等下游實(shí)驗(yàn)時(shí),DNA的存在會(huì)導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果不準(zhǔn)確。DNase I可以有效地去除RNA樣品中的DNA污染,提高RNA的純度。在提取RNA時(shí),可以在裂解細(xì)胞后加入適量的DNase I,并在適宜的條件(37℃、pH=7—8)下進(jìn)行孵育一段時(shí)間,DNase I將會(huì)發(fā)揮作用,特異性降解DNA分子,再進(jìn)行后續(xù)的RNA提純處理。該應(yīng)用場(chǎng)景下,牛胰來(lái)源和重組來(lái)源都適用,牛胰來(lái)源的應(yīng)用相對(duì)更廣泛。

02
體外轉(zhuǎn)錄

在體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)中,常用T7、T3、SP6等RNA聚合酶進(jìn)行RNA合成。然而,合成后的RNA可能會(huì)有DNA殘留,若用于mRNA疫苗生產(chǎn)制作,則必須用DNase I去除模板DNA殘留,且不能引入會(huì)引起免疫反應(yīng)的雜質(zhì)。例如,在制備mRNA疫苗時(shí),需要確保RNA樣品中不含有任何DNA污染,否則可能會(huì)影響疫苗的安全性和有效性。DNase I能夠高效地去除模板DNA,保證RNA疫苗的質(zhì)量。

03
DNA研究

1. rRNAq去除,常應(yīng)用于RNA建庫(kù)測(cè)序
在酶法rRNAq去除實(shí)驗(yàn)步驟中,單鏈DNA探針和rRNA分子雜交結(jié)合;RNase H降解雜交的rRNA; DNase I降解DNA 探針;
2、DNase I足跡實(shí)驗(yàn)(DNase I footprinting),其原理是蛋白結(jié)合在DNA片段上,能保護(hù)結(jié)合部位不被DNase I破壞,DNA分子經(jīng)酶切作用后遺留下該片段(即“足跡"),進(jìn)而可以確定其序列。
3. 缺口平移(nick translation);該方法是DNase I與E.coli DNA Polymerase I的聯(lián)合作用實(shí)現(xiàn)的。
4. 細(xì)胞凋亡TUNEL檢測(cè)。

 

翌圣生物從牛胰腺中制備高純度的DNase I,含有極低水平的核糖核酸酶和蛋白酶活性。我們提供不同的分裝規(guī)格,以便客戶(hù)在不同的應(yīng)用場(chǎng)景下使用。牛胰來(lái)源DNase I適用以下應(yīng)用場(chǎng)景:

  • RNA提取中去除不需要的DNA;

  • 在RT-PCR之前從RNA制劑中去除基因組DNA;

  • DNA研究的相關(guān)應(yīng)用。

 

翌圣生物在酶的定向進(jìn)化和純化工藝上積累了豐富的經(jīng)驗(yàn),我們提供重組來(lái)源DNase I。在重組大腸桿菌菌株中表達(dá)的DNase I,不含RNase。重組DNase I適用于以下應(yīng)用場(chǎng)景:

  • RNA提取中去除不需要的DNA;

  • 在RT-PCR之前從RNA制劑中去除基因組DNA;

  • 在生物制藥和生物加工過(guò)程中去除DNA。

  • DNA研究的相關(guān)應(yīng)用。

 

05

DNaseI選擇指南

Description

Activity

Catalog No.

Size

Price

Application

脫氧核糖核酸酶I(DNase I),來(lái)源于牛胰腺;經(jīng)色譜工藝制備,核糖核酸酶A(RNase A)活性含量極低。為凍干粉劑。貯存溫度-25℃~-15℃。

≥2000 Kunitz Units/mg protein

10607ES

10607ES15:15 KU

10607ES81:10×15 KU

555.00

4155.00

 

從樣本中提取RNA時(shí)去除gDNA。(如果是微量樣本,需要用重組來(lái)源的DNase I)

蛋白質(zhì)研究: 從蛋白制備物中去除 DNA。

脫氧核糖核酸酶I(DNase I),來(lái)源于牛胰腺;經(jīng)色譜工藝制備,核糖核酸酶A(RNase A)活性含量極低。為凍干粉劑。貯存溫度-25℃~-15℃。

≥2000 Kunitz Units/mg protein

10608ES

10608ES25:25mg

10608ES60:100mg

10608ES80:1g

 

875 .00

1275 .00

6505.00

重組來(lái)源DNase I (RNase-free),大腸桿菌重組表達(dá),不含RNase,液體形式,貯存溫度-25℃~-15℃。

2 U/μL

10325ES

10325ES80:1000 U

10325ES90:5×1000 U

10325ES91:5000 U

495.00

2395 .00

2395 .00

適用于各種應(yīng)用:從 RNA 和蛋白制備物中去除 DNA,如對(duì)RNase敏感的cDNA文庫(kù)或用于RT-PCR實(shí)驗(yàn)樣品制備。

重組來(lái)源DNase I (RNase-free),大腸桿菌重組表達(dá),GMP-grade,液體形式,貯存溫度-25℃~-15℃。

2 U/μL

10611ES

10611ES76:500U

10611ES84:2000U

10611ES92:10000U

10611ES98:100KU

645.00

1965.00

6455.00

32275.00

GMP藥用級(jí)別。用于采用藥用規(guī)格原輔料生產(chǎn),符合GMP規(guī)范的產(chǎn)品生產(chǎn)與質(zhì)量管理規(guī)程保障生產(chǎn)過(guò)程及所有原輔料可追溯。

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