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恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù),分子診斷POCT新方向

2024-12-24  閱讀(239)

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近年來(lái),隨著分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,基于核酸檢測(cè)的診斷方法已大量建立并廣泛應(yīng)用于人類(lèi)疾病的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)中。與其他的核酸擴(kuò)增技術(shù)相比,等溫?cái)U(kuò)增有快速、高效、特異的優(yōu)點(diǎn)且無(wú)需專(zhuān)用的設(shè)備,所以它一經(jīng)出現(xiàn)就被許多學(xué)者認(rèn)為是一種有可能與PCR媲美的檢測(cè)方法。

因此,相信恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)為基礎(chǔ)的診斷儀器和試劑盒的開(kāi)發(fā)和應(yīng)用將會(huì)是未來(lái)分子診斷POCT的一個(gè)新方向。

 

主流恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)原理介紹

 

1、LAMP環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)

原理:環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(loop mediated isothermal amplification,LAMP)使用具有鏈置換特性的Bst DNA聚合酶,針對(duì)靶基因的6個(gè)區(qū)域設(shè)計(jì)4種特異引物,在等溫條件下高效、快速、特異性擴(kuò)增靶標(biāo)序列,可在60-65℃進(jìn)行恒溫?cái)U(kuò)增,15-60分鐘左右即可實(shí)現(xiàn)1091010倍的核酸擴(kuò)增。

優(yōu)勢(shì)及應(yīng)用:等溫?cái)U(kuò)增因其反應(yīng)快速、特異高、設(shè)備簡(jiǎn)單易操作、結(jié)果易于鑒定等優(yōu)點(diǎn),已經(jīng)應(yīng)用于病原菌、寄生蟲(chóng)、病毒、疾病和轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)等領(lǐng)域,并且還將廣泛應(yīng)用于臨床傳染病診斷、環(huán)境監(jiān)測(cè)、食品安全等領(lǐng)域,已經(jīng)成為一種適用于分子POCT平臺(tái)的理想方法。

分類(lèi):LAMP檢測(cè)方法分為多種,包括比濁法、pH顯色法、熒光染料法(如NHB、鈣黃綠素、SYBR Green、Syto等)、熒光探針?lè)ǖ取?/span>

2、RPA重組酶聚合酶擴(kuò)增技術(shù)

原理:重組酶與引物結(jié)合形成的蛋白-DNA復(fù)合物,能在雙鏈DNA中尋找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就會(huì)發(fā)生鏈交換反應(yīng)形成并啟動(dòng)DNA合成,對(duì)模板上的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行指數(shù)式擴(kuò)增。被替換的DNA鏈與SSB結(jié)合,防止進(jìn)一步替換。在這個(gè)體系中,由兩個(gè)相對(duì)的引物起始一個(gè)合成事件,主要依賴(lài)于重組酶、Bsu酶和SSB蛋白。可以在37~42 ℃條件下,10~30 min內(nèi)實(shí)現(xiàn)待測(cè)靶標(biāo)的快速檢測(cè)。

優(yōu)勢(shì)及應(yīng)用:它具有反應(yīng)靈敏度高、特異性強(qiáng)、對(duì)儀器依賴(lài)程度低且可整合多種檢測(cè)模式等優(yōu)點(diǎn),特別適用于基層和現(xiàn)場(chǎng)即時(shí)檢測(cè),可廣泛應(yīng)用于體外診斷、動(dòng)物疫病、食品安全、生物安全、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。

分類(lèi):RPA檢測(cè)方法分為多種,包括電泳法、EXO探針?lè)?、Fpg探針?lè)?、測(cè)流層析試紙條(LF-RPA)以及絮凝分析檢測(cè)等。

 

部分產(chǎn)品性能展示

 

01 pH顯色法RT-LAMP試劑

pH顯色法RT-LAMP是將可視染料作為敏感指示劑,在60-65℃等溫條件下,利用恒溫水浴鍋或普通PCR儀完成一步法RNA核酸擴(kuò)增。30min即可通過(guò)反應(yīng)后顏色的變化,判斷是否感染病原體,結(jié)果更直觀(陽(yáng)性為橙黃色,陰性為洋紅色)。該方法適用于大批量人群的快速檢測(cè)。

推薦產(chǎn)品:

RT-LAMP pH Sensitive Dyestuff Kit13906ES)

RT-LAMP pH Sensitive Dye Chromogenic Version Freeze-Dryable Kit13920)(可凍干版)


性能展示:

 

 

02 熒光染料法RT-LAMP試劑

熒光染料法RT-LAMP是將熒光染料(如SYBR Green、Syto等)作為熒光標(biāo)記物,在擴(kuò)增反應(yīng)中與雙鏈DNA結(jié)合后,熒光信號(hào)會(huì)增強(qiáng)800-1000倍。使用熒光定量PCR儀在60-65℃恒溫條件下進(jìn)行測(cè)試,約30min后即可通過(guò)擴(kuò)增結(jié)果判斷是否感染病原體,還可搭配微流控芯片或便攜式檢測(cè)儀快速檢測(cè)。

 

推薦產(chǎn)品:RT-LAMP Dye Assay Kit(UDGplus)(13762ES)

性能展示:

 

 

RT-LAMP/RPA mix選擇指南

產(chǎn)品分類(lèi)

RT-LAMP mix

RPA mix

產(chǎn)品名稱(chēng)

RT-LAMP Dye Assay Kit(UDG plus)

RT-LAMP pH Sensitive Dyestuff Kit

RT-LAMP pH Sensitive Dye

Chromogenic Version

Freeze-Dryable Kit

Quick Fuse Amplifier

產(chǎn)品貨號(hào)

13762ES

13906ES

13920ES

16702ES

產(chǎn)品類(lèi)別

熒光染料法

pH顯色法

pH顯色法

探針?lè)?/span>

產(chǎn)品組份

2組份

Buffer、酶mix

3組份

Buffer、RT酶、Bst酶

4組份

Buffer、RT酶、

Bst酶、凍干保護(hù)劑

4組份

Buffer、酶mix、

醋酸鎂

支持凍干

支持,不含凍干保護(hù)劑

支持,含凍干保護(hù)劑

不支持

 

LAMP/RT-LAMP原酶選擇指南

產(chǎn)品分類(lèi)

Bst酶

逆轉(zhuǎn)錄酶

UDG酶

產(chǎn)品名稱(chēng)

Bst Plus

Lyophilized Bst Plus

Ⅲ Reverse Transcriptase

III Reverse Transcriptase,

Glycerol-free

UDG

UDG,Glycerol-Free

產(chǎn)品貨號(hào)

14402ES

14405ES

11111ES

11297ES

14455ES

14001ES

酶活濃度

40 U/μL

60 U/μL

200 U/μL

600 U/μL

1 U/μL

1 U/μL

產(chǎn)品組份

3組份

Buffer、酶、硫酸鎂

2組份

Bst凍干粉、復(fù)溶液

2組份

Buffer、酶

單組份

單組份

單組份

支持凍干

 

RPA原酶選擇指南

產(chǎn)品分類(lèi)

Bsu聚合酶

重組酶

重組蛋白

單鏈結(jié)合蛋白

肌酸激酶

核酸外切酶

產(chǎn)品名稱(chēng)

Bsu

T4 UvsX

T4 UvsY

gp 32

Creatine Kinase

Exonuclease III 

產(chǎn)品貨號(hào)

11078ES

11079ES

11080ES

11081ES

14502ES

14525ES

酶活濃度

5 U/μL

2 μg/μL

2 μg/μL

5 μg/μL

2 μg/μL

100 U/μL

產(chǎn)品組份

單組份

單組份

單組份

單組份

單組份

2組份

Buffer、酶

支持凍干

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