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全轉(zhuǎn)錄組研究
【全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序—研究非編碼RNA與mRNA間的靶向調(diào)控以及相互作用關(guān)系】
全轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序，采用去核糖體鏈特異性建庫(kù)方法和小片段富集篩選建庫(kù)方法，可實(shí)現(xiàn)編碼RNA和非編碼RNA的建庫(kù)、測(cè)序、信息分析及聯(lián)合分析、ceRNA等，從而快速全面準(zhǔn)確地獲得與特定生物學(xué)過程 （例如發(fā)育、疾病等）所有RNA轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)信息，通過數(shù)據(jù)分析將生物調(diào)控機(jī)制研究延伸到“ 網(wǎng)、多層面"結(jié)合的立體模式，有助于相對(duì)全面解讀生物學(xué)現(xiàn)象。
全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序有兩種方式，一種是LncRNA-Seq + Small RNA，另一種是LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA，可以更加全面的獲取CircRNA的信息。
兩種文庫(kù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：LncRNA-Seq + Small RNA；
三種文庫(kù)的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA。
全轉(zhuǎn)錄組技術(shù)路線
全轉(zhuǎn)錄組研究原料解決方案
動(dòng)物類 | 植物類 | 細(xì)菌真菌類 | ||||
樣本類型 | 動(dòng)物組織/細(xì)胞 | 細(xì)胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） |
miRNA提取 | 柱式法：19331 | 柱式法：19331 | 柱式法：19332 | 柱式法：19331 | — | — |
miRNA文庫(kù)構(gòu)建 | 敬請(qǐng)期待 | |||||
rRNA去除 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除，包含去除珠蛋白：12257+12806 RNaseH酶法去除珠蛋白：13572 | RNaseH酶法去除：12254 | 磁珠法去除：12271真菌通用型 | 磁珠法去除：12264細(xì)菌通用型/12265原核生物通用型 |
文庫(kù)構(gòu)建 | 非預(yù)混RNA建庫(kù)試劑盒：12308雙模式RNA建庫(kù)試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
LncRNA研究
長(zhǎng)鏈非編碼RNA（long non-coding RNA， LncRNA）是近年來引起廣泛關(guān)注的一種具有的調(diào)控功能的非編碼RNA。LncRNA的長(zhǎng)度在200nt以上，不編碼蛋白，物種間保守性較差，有的序列結(jié)構(gòu)與mRNA相似（含有polyA尾，存在可變剪切），有的則無這些特征。目前的研究對(duì)LncRNA的產(chǎn)生和功能機(jī)制尚未有明確的認(rèn)識(shí)，但已有多種具有重要生物功能（如癌癥發(fā)生、X染色體沉默以及與其他調(diào)控因子作用構(gòu)成復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等）的LncRNA被發(fā)現(xiàn)。
LncRNA測(cè)序技術(shù)路線
LncRNA測(cè)序原料解決方案
動(dòng)物類 | 植物類 | 細(xì)菌真菌類 | ||||
樣本類型 | 動(dòng)物組織/細(xì)胞 | 細(xì)胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） |
rRNA去除 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除，包含去除珠蛋白：12257+12806 RNaseH酶法去除珠蛋白：13572 | RNaseH酶法去除：12254 | 磁珠法去除：12271真菌通用型 | 磁珠法去除：12264細(xì)菌通用型/12265原核生物通用型 |
文庫(kù)構(gòu)建 | 非預(yù)混RNA建庫(kù)試劑盒：12308雙模式RNA建庫(kù)試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
真核轉(zhuǎn)錄組研究
真核轉(zhuǎn)錄組研究，通過RNA-seq技術(shù)獲得特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的mRNA的總和，隨后對(duì)下機(jī)的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接組裝，對(duì)基因的表達(dá)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，并進(jìn)行差異分析和功能富集分析。既能獲得該物種絕大部分基因信息又能從整體水平研究基因表達(dá)差異及功能通路變化，揭示特定生物學(xué)過程的分子機(jī)制。
真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)路線
真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序原料解決方案
動(dòng)物類 | 植物類 | 真菌類 | ||||
樣本類型 | 動(dòng)物組織/細(xì)胞 | 細(xì)胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養(yǎng)的真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（加溶壁酶10403） |
mRNA捕獲 | 12629 mRNA Isolation Master Kit | |||||
文庫(kù)構(gòu)建 | 非預(yù)混RNA建庫(kù)試劑盒：12308雙模式RNA建庫(kù)試劑盒(兼容Illumina和MGI) 非預(yù)混RNA建庫(kù)試劑盒-含mRNA捕獲：12309雙模式RNA建庫(kù)試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
circRNA研究
【circRNA測(cè)序—研究circRNA的差異表達(dá)如何影響生物學(xué)過程】
環(huán)狀RNA（circular RNA, circRNA）是一類特殊的非編碼RNA分析，測(cè)序采用測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序，針對(duì)有參考基因組樣本開展準(zhǔn)確的circRNA鑒定以及來源基因的分析， 環(huán)狀RNA測(cè)序在醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)研究領(lǐng)域應(yīng)用越來越廣泛?；诟咄繙y(cè)序，依據(jù)主流數(shù)據(jù)庫(kù)和circRNA鑒定軟件，分析項(xiàng)目物種的circRNA信息，深入挖掘circRNA在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中所發(fā)揮的重要功能。
circRNA測(cè)序技術(shù)路線
circRNA研究原料解決方案
動(dòng)物類 | 植物類 | 細(xì)菌真菌類 | ||||
樣本類型 | 動(dòng)物組織/細(xì)胞 | 細(xì)胞 | 全血 | 植物組織 | 真菌組織 | 培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌 |
RNA提取 | 磁珠法：18605/18607/18606 | 磁珠法：18600/18604 | 柱式法：19241 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 磁珠法：18534/18535/18537 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） |
rRNA去除 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除：12257 | RNaseH酶法去除，包含去除珠蛋白：12257+12806 RNaseH酶法去除珠蛋白：13572 | RNaseH酶法去除：12254 | 磁珠法去除：12271真菌通用型 | 磁珠法去除：12264細(xì)菌通用型/12265原核生物通用型 |
線性RNA消化 | 14606 RNase R 去除線性RNA分子 | |||||
文庫(kù)構(gòu)建 | 非預(yù)混RNA建庫(kù)試劑盒：12308雙模式RNA建庫(kù)試劑盒(兼容Illumina和MGI) | |||||
宏轉(zhuǎn)錄組
【宏轉(zhuǎn)錄組—捕捉微生態(tài)微環(huán)境活性微生物動(dòng)態(tài)變化】
宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：（Metatranscriptome Sequencing/ Metatranscriptomics）從整體水平研究特定環(huán)境中所有群體基因組轉(zhuǎn)錄情況和調(diào)控規(guī)律，以微生態(tài)微環(huán)境中全部RNA為研究對(duì)象， 結(jié)合高通量測(cè)序從轉(zhuǎn)錄水平研究復(fù)雜微生物群落變化，挖掘發(fā)揮功能的活性基因。
宏轉(zhuǎn)錄組研究原料解決方案
樣本類型 | 培養(yǎng)的細(xì)菌和真菌 | 臨床樣本 |
RNA提取 | 柱式法：19301（真菌需要加溶壁酶10403） | 柱式法：19321（病毒DNA/RNA提?。?/span> 磁珠法：18521（病毒DNA/RNA提取） 18306（病原DNA/RNA提?。?/span> |
rRNA去除 | 3 min快速去除：12258（人源去除） | |
文庫(kù)構(gòu)建 | 方案1. Total RNA建庫(kù)： 12308ES雙模式RNA建庫(kù)試劑盒(兼容Illumina和MGI) 方案2. cDNA酶切建庫(kù)：13488ES cDNA合成模塊+12316ES 快速酶切法建庫(kù)試劑盒 | |
產(chǎn)品推薦
產(chǎn)品名稱 | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
Hieff NGS ® EvoMax RNA Library Prep Kit（dUTP） | 12340ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS® EvoMax RNA Library Prep Kit(dNTP) 預(yù)裝板RNA建庫(kù)試劑盒(不含放線菌素D) | 12341ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit 雙模式RNA建庫(kù)試劑盒(兼容Illumina和MGI) | 12308ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version) | 12310ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit V2 | 12629ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS MaxUp Human rRNA Depletion Kit(rRNA & ITS/ETS) | 12257ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit(Plant) | 12254ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human,100-1,000 ng) 一步快速去除核糖體RNA試劑盒(人) | 12258ES24/96 | 24 T/ 96 T |
Hieff NGS® MagSP rRNA Removal Kit (Bacteria(G- and G+)) with purification beads | 12264ES24/96 | 24 T/ 96 T |
