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生物技術(shù)作為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)育種的重要手段之一，主要是通過(guò)轉(zhuǎn)基因技術(shù)培育出具有高產(chǎn)、抗蟲(chóng)、抗病、抗除草劑、抗旱等性狀的農(nóng)作物，其產(chǎn)業(yè)發(fā)展十分迅速，已在多個(gè)作物育種上取得了顯著的成績(jī)。

目前，生物技術(shù)育成的具有抗蟲(chóng)、抗除草劑的轉(zhuǎn)基因大豆、玉米、棉花、油菜等轉(zhuǎn)基因作物已經(jīng)在上獲得廣泛應(yīng)用。

我國(guó)在生物育種方面不斷加大研究投入力度，充分利用分子標(biāo)記輔助育種、轉(zhuǎn)基因育種等生物技術(shù)手段，相繼培育出了超級(jí)稻、轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)棉等一批突破性的研究成果，在其推廣應(yīng)用中有效帶動(dòng)了生物種業(yè)的迅猛發(fā)展，也促進(jìn)了我國(guó)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展。

截至2012年，我國(guó)有7種轉(zhuǎn)基因植物通過(guò)了商品化許可（即耐貯藏番茄、變色矮牽牛、抗病毒甜椒和辣椒、抗病毒番茄、抗蟲(chóng)棉花、抗蟲(chóng)歐洲黑楊）。

2009年，我國(guó)政府發(fā)放了擁有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)水稻和轉(zhuǎn)基因植酸酶玉米，成為*推出抗蟲(chóng)水稻和轉(zhuǎn)植酸酶基因玉米并進(jìn)行產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用的國(guó)家。轉(zhuǎn)基因抗蟲(chóng)棉作為應(yīng)用推廣zui為成功的案例，在生物種業(yè)領(lǐng)域有非常廣的應(yīng)用。

截至2011年，通過(guò)審定的國(guó)產(chǎn)抗蟲(chóng)棉品種接近300個(gè)，其中半數(shù)左右的品種通過(guò)了國(guó)家審定；國(guó)產(chǎn)抗蟲(chóng)棉累計(jì)推廣面積4.34億畝，已占國(guó)內(nèi)抗蟲(chóng)棉*的95%以上，累計(jì)減少農(nóng)藥使用2.17億公斤，實(shí)現(xiàn)社會(huì)經(jīng)濟(jì)效益607億元。

據(jù)統(tǒng)計(jì)，目前全國(guó)持證種子企業(yè)多達(dá)8700家左右，三分之二企業(yè)的注冊(cè)資本在100萬(wàn)~500萬(wàn)元的中小企業(yè)，90%以上的企業(yè)沒(méi)有能力。

注冊(cè)資本在3000萬(wàn)元以上的只有200多家，實(shí)現(xiàn)繁育推一體化、經(jīng)營(yíng)范圍覆蓋全國(guó)的企業(yè)僅100余家，我國(guó)種子企業(yè)數(shù)量多、規(guī)模小、能力弱的劣勢(shì)非常明顯，與世界發(fā)達(dá)國(guó)家還有較大差距。

目前我國(guó)生物種業(yè)仍然以中小企業(yè)為主， 大部分還不具備研究開(kāi)發(fā)投入的能力，缺少擁有技術(shù)水平和實(shí)力雄厚的；企業(yè)創(chuàng)新人才匱乏，產(chǎn)權(quán)少，核心技術(shù)缺乏，產(chǎn)業(yè)配套能力較弱，產(chǎn)業(yè)鏈還不能有機(jī)運(yùn)轉(zhuǎn)。

農(nóng)科教脫節(jié)、生物育種產(chǎn)業(yè)與其下游支撐產(chǎn)業(yè)和服務(wù)業(yè)配給不足，缺乏整體規(guī)劃，國(guó)家戰(zhàn)略、宏觀組織仍需要加強(qiáng)。

現(xiàn)階段，我國(guó)生物育種產(chǎn)業(yè)中大部分仍處于起步階段，其投資主體仍以政府投入為主，企業(yè)和個(gè)人所占比例較小，生物育種產(chǎn)業(yè)投資周期長(zhǎng)、利用效率低等使得我國(guó)生物種業(yè)的發(fā)展仍需要一段艱難的上升階段。